Ő volt a Naruto kitalálója. Előképző iskolájában szerepelt a „Doraemon” TV-showban, barátaival együtt. A műsor lényege az volt, hogy a játékosoknak képeket, vagy személyeket kellett rajzolnia. Kisimoto mindig is maximalista volt, mindig kioktatta társait, ha nem sikerült nekik valami.Általános iskoláját szintén rajzolással töltötte. Minden füzetét, jegyzetét telerajzolta. Még bújócskázás alatt is rajzolt, míg meg nem találták. A TV-ben csak a Doraemont nézte, mígnem meglátott egy animét, a Mobile Suit Gundamot. Utána állandóan ennek az animének a karaktereit rajzolta.Később megismerkedett egy másik animével, Torijama Akira egyik híres alkotásával, a Dr. Slumppal. Az általános iskola végéhez közeledve Torijama leghíresebb alkotása, a Dragon Ball nagy vonzalmat ébresztett Kisimotóban. Megszállott Dragon Ball- és Torijama-rajongó lett.Középiskolai éveit is rajzolással töltötte. Emellett a baseball is szerves része lett életének is. A középiskola (mint nekünk sem) Kishimoto-nak sem volt könnyű és a sok tanulni való lekötötte, így a rajzolás igen csak a háttérbe szorúlt, főleg, hogy ő maga is azt mondta, hogy "Ő már öreg a rajzolgatáshoz". Aztán egyszer meglátott egy plakátot, melyen az Akira című művet hirdette, újra elkezdett rajzolni. A Középsuli végén megrajzolta első kis mangáját, amit be is küldött a Jump Magazin-hoz egy pályázatra, annak ellenére, hogy se anyjának sem a öccsének nem tetszett. A pályázaton nem nyert. A Középsuli végén elég rosszúl végzett, 38. lett a 39 fős osztályból, így sajnos nem tanulhatott tovább. Ennek ellenére is tovább küzdött (akárcsak Naruto xD) és valóra akarta váltani álmát, hogy mangaka legyen. Végül, 1996-ban sikerült neki. Az első mangája, amit ki is adtak a Karakuri címet viselte. Aztán 1999-ben a jump Magazin kiadta a Naruto-t. s szerencsénkre (:)) anime is készült belőle és azóta is fut, mind a manga, mind az anime.